台鐵第408次太魯閣號列車於4月2日上午9時28分45秒行經北迴線和仁段清水隧道北口時，與滑落邊坡侵入路線的工程車相撞出軌，並撞進隧道，造成49人死亡，213人受傷，震驚全台。此事件凸顯出政府無法提供花東地區一條安全的交通路線，引發民怨不滿。至4月20日，交通部長林佳龍請辭下台。

台鐵近年來發生多起事故，引發社會關注。在野黨抨擊政府為官僚殺人，國民黨提出蘇揆內閣存在4大缺失，包括對重大公共工程採購原則不當、強制限定最低標導致弊端頻傳、未成立台鐵改革推動小組以及未核定台鐵總體檢報告等問題。台鐵局長懸缺3個月，引發派系鬥爭，遲遲未能決定人選。

交通部花了數月時間，才於7月公布5月已完成的行政調查報告，並僅懲處台鐵副局長，引起民間團體批評調查結果不力，無法讓人民信服。